|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
---|---|---|---|
d1vk0a_ | Ribonuclease H-like motif | Ribonuclease H-like | DnaQ-like 3'-5' exonuclease |
Added to library: Tue Mar 16 14:09:01 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | S | A | S | F | D | G | P | K | F | K | X | T | D | G | S | Y | V | Q | T | K | T | I | D | V | G | S | S | T | D | I | S | P | Y | L | S | L | I | R | E | D | S | I | L | N | G | N | R | A | V | I | F | D | V | Y | W | D | V | G | F | T | K | T | S | G | W | S | L | S | S | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | T | T | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | S | T | R | N | L | C | L | F | L | R | L | P | K | P | F | H | D | N | L | K | D | L | Y | R | F | F | A | S | K | F | V | T | F | V | G | V | Q | I | E | E | D | L | D | L | L | R | E | N | H | G | L | V | I | R | N | A | I | N | V | G | K | L | A | A | E | A | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | T | S | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 |
Sequence | T | L | V | L | E | F | L | G | T | R | E | L | A | H | R | V | L | W | S | D | L | G | Q | L | D | S | I | E | A | K | W | E | K | A | G | P | E | E | Q | L | E | A | A | A | I | E | G | W | L | I | V | N | V | W | D | Q | L | S | D | E | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | T | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|