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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1um8a_ | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases | P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases | Extended AAA-ATPase domain |
Added to library: Tue Mar 16 13:54:20 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | L | S | Y | I | P | A | P | K | E | L | K | A | V | L | D | N | Y | V | I | G | Q | E | Q | A | K | K | V | F | S | V | A | V | Y | N | H | Y | K | R | L | S | F | K | E | K | L | K | K | Q | D | N | Q | D | S | N | V | E | L | E | H | L | E | E | V | E | L | S | K | S | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | L | L | I | G | P | T | G | S | G | K | T | L | M | A | Q | T | L | A | K | H | L | D | I | P | I | A | I | S | D | A | T | S | L | T | V | E | N | I | L | T | R | L | L | Q | A | S | D | W | N | V | Q | K | A | Q | K | G | I | V | F | I | D | E | I | D | K | I | G | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | Q | Q | A | L | L | K | I | V | E | G | S | L | V | N | Q | I | D | T | S | D | I | L | F | I | C | A | G | A | F | D | G | L | A | E | I | I | K | K | R | T | T | Q | N | V | L | G | F | T | Q | E | K | M | S | K | K | E | Q | E | A | I | L | H | L | V | Q | T | H | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | T | Y | G | L | I | P | E | L | I | G | R | L | P | V | L | S | T | L | D | S | I | S | L | E | A | M | V | D | I | L | Q | K | P | K | N | A | L | I | K | Q | Y | Q | Q | L | F | K | M | D | E | V | D | L | I | F | E | E | E | A | I | K | E | I | A | Q | L | A | L | E | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||
Sequence | K | T | G | A | R | G | L | R | A | I | I | E | D | F | C | L | D | I | M | F | D | L | P | K | L | K | G | S | E | V | R | I | T | K | D | C | V | L | K | Q | A | E | P | L | I | I | A | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | G | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S |
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