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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1tubb1 | Tubulin nucleotide-binding domain-like | Tubulin nucleotide-binding domain-like | Tubulin, GTPase domain |
Added to library: Tue Mar 16 12:57:31 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | R | E | I | V | H | I | Q | A | G | Q | C | G | N | Q | I | G | A | K | F | W | E | V | I | S | D | E | H | G | I | D | P | T | G | S | Y | H | G | D | S | D | L | Q | L | E | R | I | N | V | Y | Y | N | E | A | A | G | N | K | Y | V | P | R | A | I | L | V | D | L | E | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | T | M | D | S | V | R | S | G | P | F | G | Q | I | F | R | P | D | N | F | V | F | G | Q | S | G | A | G | N | N | W | A | K | G | H | Y | T | E | G | A | E | L | V | D | S | V | L | D | V | V | R | K | E | S | E | S | C | D | C | L | Q | G | F | Q | L | T | H | S | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | G | T | G | S | G | M | G | T | L | L | I | S | K | I | R | E | E | Y | P | D | R | I | M | N | T | F | S | V | V | P | S | P | K | V | S | D | T | V | V | E | P | Y | N | A | T | L | S | V | H | Q | L | V | E | N | T | D | E | T | Y | C | I | D | N | E | A | L | Y | D | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | C | F | R | T | L | K | L | T | T | P | T | Y | G | D | L | N | H | L | V | S | A | T | M | S | G | V | T | T | C | L | R | F | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T | B | T | T | B |
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