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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1stma_ | Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins) | Satellite viruses | Satellite viruses |
Added to library: Tue Mar 16 13:38:09 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | A | A | T | S | L | V | Y | D | T | C | Y | V | T | L | T | E | R | A | T | T | S | F | Q | R | Q | S | F | P | T | L | K | G | M | G | D | R | A | F | Q | V | V | A | F | T | I | Q | G | V | S | A | A | P | L | M | Y | N | A | R | L | Y | N | P | G | D | T | D | S | V | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | T | G | V | Q | L | M | G | T | V | P | R | T | V | R | L | T | P | R | V | G | Q | N | N | W | F | F | G | N | T | E | E | A | E | T | I | L | A | I | D | G | L | V | S | T | K | G | A | N | A | P | S | N | T | V | I | V | T | G | C | F | R | L | A | P | S | E | L | Q | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | B | T | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
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