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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1rh8a_ | C2 domain-like | C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB) | Synaptotagmin-like (S variant) |
Added to library: Tue Mar 16 11:58:15 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | S | H | P | I | T | G | E | I | Q | L | Q | I | N | Y | D | L | G | N | L | I | I | H | I | L | Q | A | R | N | L | V | P | R | D | N | N | G | Y | S | D | P | F | V | K | V | Y | L | L | P | G | R | G | Q | V | M | V | V | Q | N | A | S | A | E | Y | K | R | R | T | K | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | Q | K | S | L | N | P | E | W | N | Q | T | V | I | Y | K | S | I | S | M | E | Q | L | M | K | K | T | L | E | V | T | V | W | D | Y | D | R | F | S | S | N | D | F | L | G | E | V | L | I | D | L | S | S | T | S | H | L | D | N | T | P | R | W | Y | P | L | K | E | Q | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | B |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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