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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1r6fa_ | Virulence-associated V antigen | Virulence-associated V antigen | Virulence-associated V antigen |
Added to library: Tue Mar 16 13:24:23 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | S | V | L | E | E | L | V | Q | L | V | A | A | A | N | I | D | I | S | I | K | N | R | V | I | T | D | D | I | E | L | L | K | K | I | L | A | Y | F | L | P | E | D | A | I | L | K | G | G | H | D | N | Q | L | Q | N | G | I | K | R | V | K | E | F | L | E | S | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | - | B | T | T | S | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | T | Q | W | E | L | R | A | F | M | A | V | M | H | F | S | L | T | A | D | R | I | D | D | D | I | L | K | V | I | V | D | S | M | N | H | H | G | D | A | R | S | K | L | R | E | E | L | A | E | L | T | A | E | L | K | I | Y | S | V | I | Q | A | E | I | N | K | H | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | S | G | T | I | N | I | H | D | K | S | I | N | L | M | D | K | N | L | Y | G | Y | T | D | E | E | I | F | K | A | S | A | E | Y | K | I | L | E | K | M | P | Q | T | T | I | Q | V | D | G | S | E | K | K | I | V | S | I | K | D | F | L | G | S | E | N | K | R | T | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | S | S | T | S | T | T | S | S | S | S | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . |
Sequence | L | G | N | L | K | N | S | Y | S | Y | N | K | D | S | D | K | S | R | P | L | N | D | L | V | S | Q | K | T | T | Q | L | S | D | I | T | S | R | F | N | S | A | I | E | A | L | N | R | F | I | Q | K | Y | D | S | V | M | Q | R | L | L | D | D | ||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T |
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