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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1r17a2 | Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f | Bacterial adhesins | Fibrinogen-binding domain |
Added to library: Tue Mar 16 13:47:45 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | K | P | N | E | N | R | T | A | N | L | Q | S | M | F | T | N | I | D | T | K | N | H | T | V | E | Q | T | I | Y | I | N | P | L | R | Y | S | A | K | E | T | N | V | N | I | S | G | N | G | D | E | G | S | T | I | I | D | D | S | T | I | I | K | V | Y | K | V | G | D | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | B | S | S | B | B | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | N | L | P | D | S | N | R | I | Y | D | Y | S | E | Y | E | D | V | T | N | D | D | Y | A | Q | L | G | N | N | N | D | V | N | I | N | F | G | N | I | D | S | P | Y | I | I | K | V | I | S | K | Y | D | P | N | K | D | D | Y | T | T | I | Q | Q | T | V | T | M | Q | T | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | I | N | E | Y | T | G | E | F | R | T | A | S | Y | D | N | T | I | A | F | S | T | S | S | G | Q | G | Q | G | D | L | P | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T |
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