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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1qwta_ | SMAD/FHA domain | SMAD/FHA domain | Interferon regulatory factor 3 (IRF3), transactivation domain |
Added to library: Tue Mar 16 13:22:31 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | N | P | L | K | R | L | L | V | P | G | E | E | W | E | F | E | V | T | A | F | Y | R | G | R | Q | V | F | Q | Q | T | I | S | C | P | E | G | L | R | L | V | G | S | E | V | G | D | R | T | L | P | G | W | P | V | T | L | P | D | P | G | M | S | L | T | D | R | G | V | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | S | T | T | B | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | Y | V | R | H | V | L | S | C | L | G | G | G | L | A | L | W | R | A | G | Q | W | L | W | A | Q | R | L | G | H | C | H | T | Y | W | A | V | S | E | E | L | L | P | N | S | G | H | G | P | D | G | E | V | P | K | D | K | E | G | G | V | F | D | L | G | P | F | I | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | I | T | F | T | E | G | S | G | R | S | P | R | Y | A | L | W | F | C | V | G | E | S | W | P | Q | D | Q | P | W | T | K | R | L | V | M | V | K | V | V | P | T | C | L | R | A | L | V | E | M | A | R | V | G | G | A | S | S | L | E | N | T | V | D | L | H | I | S | N | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | H | P | L | S | L | T | S | D | Q | Y | K | A | Y | L | Q | D | L | V | E | G | M | D | F | Q | G | P | G | E | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T |
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