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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1q5za_ | Invasion protein A (SipA) , C-terminal actin binding domain | Invasion protein A (SipA) , C-terminal actin binding domain | Invasion protein A (SipA) , C-terminal actin binding domain |
Added to library: Tue Mar 16 12:03:15 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | F | S | G | L | K | F | K | Q | N | S | F | L | S | T | V | P | S | V | T | N | M | H | S | M | H | F | D | A | R | E | T | F | L | G | V | I | R | K | A | L | E | P | D | T | S | T | P | F | P | V | R | R | A | F | D | G | L | R | A | E | I | L | P | N | D | T | I | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | B | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | A | L | K | A | Q | C | S | D | I | D | K | H | P | E | L | K | A | K | M | E | T | L | K | E | V | I | T | H | H | P | Q | K | E | K | L | A | E | I | A | L | Q | F | A | R | E | A | G | L | T | R | L | K | G | E | T | D | Y | V | L | S | N | V | L | D | G | L | I | G | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | S | W | R | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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