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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1pixa3 | ClpP/crotonase | ClpP/crotonase | Biotin dependent carboxylase carboxyltransferase domain |
Added to library: Tue Mar 16 12:38:03 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | D | P | E | F | F | R | V | D | D | P | K | A | P | A | F | P | A | D | D | L | Y | S | M | V | P | L | N | D | K | R | A | Y | D | I | Y | N | V | I | A | R | L | F | D | N | S | E | L | H | E | Y | K | K | G | Y | G | P | E | M | V | T | G | L | A | K | V | N | G | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | B | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | G | V | V | A | N | V | Q | G | L | L | M | N | Y | P | E | Y | K | A | A | G | S | V | G | I | G | G | K | L | Y | R | Q | G | L | V | K | M | N | E | F | V | T | L | C | A | R | D | R | L | P | I | V | W | I | Q | D | T | T | G | I | D | V | G | N | D | A | E | K | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | L | G | L | G | Q | S | L | I | Y | S | I | Q | T | S | H | I | P | Q | F | E | I | T | L | R | K | G | T | A | A | A | H | Y | V | L | G | G | P | Q | G | N | D | T | N | A | F | S | I | G | T | A | A | T | E | I | A | V | M | N | G | E | T | A | A | T | A | M | Y | S | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | L | A | K | D | R | K | A | G | K | D | L | Q | P | T | I | D | K | M | N | N | L | I | Q | A | F | Y | T | K | S | R | P | K | V | C | A | E | L | G | L | V | D | E | I | V | D | M | N | K | I | R | G | Y | V | E | A | F | T | E | A | A | Y | Q | N | P | E | S | I | C | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | H | Q | M | I | L | P | R | A | I | R | E | F | E | T | F | V | K | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S |
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