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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1ooaa2 | Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f | p53-like transcription factors | Rel/Dorsal transcription factors, DNA-binding domain |
Added to library: Tue Mar 16 12:09:54 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | G | P | Y | L | Q | I | L | E | Q | P | K | Q | R | G | F | R | F | R | Y | V | C | E | G | P | S | H | G | G | L | P | G | A | S | S | E | K | N | K | K | S | Y | P | Q | V | K | I | C | N | Y | V | G | P | A | K | V | I | V | Q | L | V | T | N | G | K | N | I | H | L | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | B | B | G | G | G | S | B | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | H | S | L | V | G | K | H | C | E | D | G | V | C | T | V | T | A | G | P | K | D | M | V | V | G | F | A | N | L | G | I | L | H | V | T | K | K | K | V | F | E | T | L | E | A | R | M | T | E | A | C | I | R | G | Y | N | P | G | L | L | V | H | S | D | L | A | Y | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | T | S | S | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | E | G | G | G | D | R | Q | L | T | D | R | E | K | E | I | I | R | Q | A | A | V | Q | Q | T | K | E | M | D | L | S | V | V | R | L | M | F | T | A | F | L | P | D | S | T | G | S | F | T | R | R | L | E | P | V | V | S | D | A | I | Y | D | S | K | A | P | N | A | S | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | B | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | K | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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