|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
---|---|---|---|
d1o7qa_ | Nucleotide-diphospho-sugar transferases | Nucleotide-diphospho-sugar transferases | alpha-1,3-galactosyltransferase-like |
Added to library: Tue Mar 16 14:09:00 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | K | L | K | L | S | D | W | F | N | P | F | K | R | P | E | V | V | T | M | T | K | W | K | A | P | V | V | W | E | G | T | Y | N | R | A | V | L | D | N | Y | Y | A | K | Q | K | I | T | V | G | L | T | V | F | A | V | G | R | Y | I | E | H | Y | L | E | E | F | L | T | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | S | T | T | S | B | T | T | S | B | T | T | S | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | K | H | F | M | V | G | H | P | V | I | F | Y | I | M | V | D | D | V | S | R | M | P | L | I | E | L | G | P | L | R | S | F | K | V | F | K | I | K | P | E | K | R | W | Q | D | I | S | M | M | R | M | K | T | I | G | E | H | I | V | A | H | I | Q | H | E | V | D | F | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | C | M | D | V | D | Q | V | F | Q | D | K | F | G | V | E | T | L | G | E | S | V | A | Q | L | Q | A | W | W | Y | K | A | D | P | N | D | F | T | Y | E | R | R | K | E | S | A | A | Y | I | P | F | G | E | G | D | F | Y | Y | H | A | A | I | F | G | G | T | P | T | Q | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | N | I | T | Q | E | C | F | K | G | I | L | K | D | K | K | N | D | I | E | A | Q | W | H | D | E | S | H | L | N | K | Y | F | L | L | N | K | P | T | K | I | L | S | P | E | Y | C | W | D | Y | H | I | G | L | P | A | D | I | K | L | V | K | M | S | W | Q | T | K | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | B | G | G | G | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | V | V | R | N | N | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|