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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1n67a2 | Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f | Bacterial adhesins | Fibrinogen-binding domain |
Added to library: Tue Mar 16 12:14:19 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | K | Y | G | K | F | Y | N | L | S | I | K | G | T | I | D | Q | I | D | K | T | N | N | T | Y | R | Q | T | I | Y | V | N | P | S | G | D | N | V | I | A | P | V | L | T | G | N | L | K | P | N | T | D | S | N | A | L | I | D | Q | Q | N | T | S | I | K | V | Y | K | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | A | A | D | L | S | E | S | Y | F | V | N | P | E | N | F | E | D | V | T | N | S | V | N | I | T | F | P | N | P | N | Q | Y | K | V | E | F | N | T | P | D | D | Q | I | T | T | P | Y | I | V | V | V | N | G | H | I | D | P | N | S | K | G | D | L | A | L | R | S | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | G | G | G | G | G | G | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . |
Sequence | Y | G | Y | N | S | N | I | I | W | R | S | M | S | W | D | N | E | V | A | F | N | N | G | S | G | S | G | D | G | I | D | K | P | V | V | P | E | Q | P | D | E | P | G | E | I | E | P | I | P | E | K | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S |
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