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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1n67a1 | Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f | Bacterial adhesins | Fibrinogen-binding domain |
Added to library: Tue Mar 16 13:43:51 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | T | D | I | T | N | Q | L | T | N | V | T | V | G | I | D | S | G | T | T | V | Y | P | H | Q | A | G | Y | V | K | L | N | Y | G | F | S | V | P | N | S | A | V | K | G | D | T | F | K | I | T | V | P | K | E | L | N | L | N | G | V | T | S | T | A | K | V | P | P | I | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | S | G | G | G | T | T | T | T | T | B | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | G | D | Q | V | L | A | N | G | V | I | D | S | D | G | N | V | I | Y | T | F | T | D | Y | V | N | T | K | D | D | V | K | A | T | L | T | M | P | A | Y | I | D | P | E | N | V | K | K | T | G | N | V | T | L | A | T | G | I | G | S | T | T | A | N | K | T | V | L | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | S | T | T | T | S | S | T | T |   | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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