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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1m4ua_ | Cystine-knot cytokines | Cystine-knot cytokines | Noggin |
Added to library: Tue Mar 16 13:30:52 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | Q | H | Y | L | H | I | R | P | A | P | S | D | N | L | P | L | V | D | L | I | E | H | P | D | P | I | F | D | P | K | E | K | D | L | N | E | T | L | L | R | S | L | L | G | G | H | Y | D | P | G | F | M | A | T | S | P | P | E | D | R | P | G | G | A | E | D | L | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | D | Q | L | L | R | Q | R | P | S | G | A | M | P | S | E | I | K | G | L | E | F | S | E | G | L | A | Q | G | K | K | Q | R | L | S | K | K | L | R | R | K | L | Q | M | W | L | W | S | Q | T | F | C | P | V | L | Y | A | W | N | D | L | G | S | R | F | W | P | R | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | K | V | G | S | C | F | S | K | R | S | C | S | V | P | E | G | M | V | C | K | P | S | K | S | V | H | L | T | V | L | R | W | R | C | Q | R | R | G | G | Q | R | C | G | W | I | P | I | Q | Y | P | I | I | S | E | C | K | C | S | C | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S |
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