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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1m2vb2 | Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f | beta-sandwich domain of Sec23/24 | beta-sandwich domain of Sec23/24 |
Added to library: Tue Mar 16 13:42:06 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | L | T | P | A | Q | E | Q | L | H | Q | Q | I | R | P | M | N | Q | L | Y | P | I | D | L | L | T | E | L | P | P | P | I | T | D | L | T | L | P | P | P | P | L | V | I | P | P | E | R | M | L | V | P | S | E | L | S | N | A | S | P | D | Y | I | R | S | T | L | N | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | K | N | S | S | L | L | K | K | S | K | L | P | F | G | L | V | I | R | P | Y | Q | H | L | Y | D | C | M | E | T | V | M | R | A | R | G | S | T | G | L | R | M | S | R | F | Y | G | H | F | F | N | R | S | S | D | L | C | A | F | S | T | M | P | R | D | Q | S | Y | L | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | S | S | S | T | T | S | S | S | B | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | |
Sequence | E | V | N | V | D | E | S | I | M | A | D | Y | C | Y | V | Q | V | A | V | L | L | S | L | N | N | S | Q | R | R | I | R | I | I | T | L | A | M | P | T | T | E | S | L | A | E | V | Y | A | S | A | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | T | T | T | S | T |
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