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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1m1jb1 | Fibrinogen C-terminal domain-like | Fibrinogen C-terminal domain-like | Fibrinogen C-terminal domain-like |
Added to library: Tue Mar 16 13:44:23 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | P | C | V | A | S | C | N | I | P | V | V | S | G | R | E | C | E | D | I | Y | R | K | G | G | E | T | S | E | M | Y | I | I | Q | P | D | P | F | T | T | P | Y | R | V | Y | C | D | M | E | T | D | N | G | G | W | T | L | I | Q | N | R | Q | D | G | S | V | N | F | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | W | D | E | Y | K | R | G | F | G | N | I | A | K | S | G | G | K | K | Y | C | D | T | P | G | E | Y | W | L | G | N | D | K | I | S | Q | L | T | K | I | G | P | T | K | V | L | I | E | M | E | D | W | N | G | D | K | V | S | A | L | Y | G | G | F | T | I | H | N | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | K | Y | Q | L | S | V | S | N | Y | K | G | N | A | G | N | A | L | M | E | G | A | S | Q | L | Y | G | E | N | R | T | M | T | I | H | N | G | M | Y | F | S | T | Y | D | R | D | N | D | G | W | L | T | T | D | P | R | K | Q | C | S | K | E | D | G | G | G | W | W | Y | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | B | B | T | T | B | S | S | S | T | T | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . |
Sequence | R | C | H | A | A | N | P | N | G | R | Y | Y | W | G | G | T | Y | S | W | D | M | A | K | H | G | T | D | D | G | I | V | W | M | N | W | K | G | S | W | Y | S | M | K | K | M | S | M | K | I | K | P | Y | F | P | D | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | B | T | T | S | B | G | G | G | S | T | T | S | S | B | S | S | S | B | S |
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