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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1ldja1 | DNA/RNA-binding 3-helical bundle | "Winged helix" DNA-binding domain | SCF ubiquitin ligase complex WHB domain |
Added to library: Tue Mar 16 12:47:39 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | M | K | T | E | Q | K | Q | E | Q | E | T | T | H | K | N | I | E | E | D | R | K | L | L | I | Q | A | A | I | V | R | I | M | K | M | R | K | V | L | K | H | Q | Q | L | L | G | E | V | L | T | Q | L | S | S | R | F | K | P | R | V | P | V | I | K | K | C | I | D | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | E | K | E | Y | L | E | R | V | D | G | E | K | D | T | Y | S | Y | L | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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