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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | Fold | Superfamily | Family | 
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| d1laja_ | Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins) | Positive stranded ssRNA viruses | Bromoviridae-like VP | 
| Added to library: Tue Mar 16 14:03:53 2010 | |
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| Links to external resources | |
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| Sequence | N | I | A | S | S | S | A | P | S | L | Q | H | P | T | F | I | A | S | K | K | C | R | A | G | Y | T | Y | T | S | L | D | V | R | P | T | R | T | E | K | D | K | S | F | G | Q | R | L | I | I | P | V | P | V | S | E | Y | P | K | K | K | V | S | C | V | Q | V | R | L | N | P | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  | S | S | S | S | S | S | S |  |  |  |  | S | S |  |  |  |  |  | T | T | T | T | T | T | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | S | P | K | F | N | S | T | I | W | V | S | L | R | R | L | D | E | T | T | L | L | T | S | E | N | V | F | K | L | F | T | D | G | L | A | V | L | I | Y | Q | H | V | P | T | G | I | Q | P | N | N | K | I | T | F | D | M | S | N | V | G | A | E | I | G | D | M | G | K | Y | A | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | T | T |  |  |  |  |  |  | T | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  | T | S | S | S |  |  |  | S | S | S | S | S |  |  |  | T | T | T |  |  |  |  |  |  | T | T |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | 
| Sequence | L | I | V | Y | S | K | D | D | V | L | E | A | D | E | M | V | I | H | I | D | I | E | H | Q | R | I | P | S | A | S | T | L | P | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  | S | S | S | T | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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