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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | Fold | Superfamily | Family | 
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| d1jvaa1 | Hedgehog/intein (Hint) domain | Hedgehog/intein (Hint) domain | Intein (protein splicing domain) | 
| Added to library: Tue Mar 16 12:27:49 2010 | |
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| Links to external resources | |
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| Sequence | V | G | S | F | A | K | G | T | N | V | L | M | A | D | G | S | I | E | C | I | E | N | I | E | V | G | N | K | V | M | G | K | D | G | R | P | R | E | V | I | K | L | P | R | G | R | E | T | M | Y | S | V | V | Q | K | S | E | V | P | E | L | L | K | F | T | C | N | A | T | N | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  | T | T |  |  |  | B | T | T | S |  |  |  | G | G | G | T | T |  |  |  | T | T | S | S |  |  |  | B |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | E | L | V | V | R | T | P | R | S | V | R | R | L | S | R | T | I | K | G | V | E | Y | F | E | V | I | T | F | E | M | G | Q | K | K | A | P | D | G | R | I | V | E | L | V | K | E | V | S | K | S | Y | P | I | S | E | G | P | E | R | A | N | E | L | V | E | S | Y | R | K | A | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | G | G | G | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | 
| Sequence | S | N | K | A | Y | F | E | W | T | I | E | A | R | D | L | S | L | L | G | S | H | V | R | K | A | T | Y | Q | T | Y | A | C | R | G | F | Y | F | E | L | Q | E | L | K | E | D | D | Y | Y | G | I | T | L | S | D | D | S | D | H | Q | F | L | L | A | N | Q | V | V | V | H | S | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  | G | G | G | G | G | G | S |  |  |  |  |  |  | B |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | B | S | S | S | S |  |  |  | B | T | T | B |  |  |  |   | . | . | . | . | ||||||||
| Sequence | S | G | E | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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