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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1j5wa_ | Class II aaRS and biotin synthetases | Class II aaRS and biotin synthetases | Class II aminoacyl-tRNA synthetase (aaRS)-like, catalytic domain |
Added to library: Tue Mar 16 14:26:35 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | Y | L | Q | D | V | I | X | K | L | N | D | F | W | A | S | K | G | C | L | L | E | Q | P | Y | D | X | E | V | G | A | G | T | F | H | P | A | T | F | F | G | S | L | R | K | G | P | W | K | V | A | Y | V | Q | P | S | R | R | P | T | E | N | P | N | R | L | Q | R | Y | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | G | G | G | S | T | G | G | G | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | Y | Q | V | I | I | K | P | S | P | E | N | S | Q | E | L | Y | L | E | S | L | E | Y | L | G | I | N | L | K | E | H | D | I | R | F | V | E | D | N | W | E | S | P | T | L | G | A | W | G | V | G | W | E | V | W | L | D | G | X | E | I | T | Q | F | T | Y | F | Q | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | G | I | S | L | K | D | I | P | L | E | I | T | Y | G | L | E | R | I | A | X | Y | L | Q | G | V | D | N | V | Y | E | V | Q | W | N | E | N | V | K | Y | G | D | V | F | L | E | N | E | R | E | F | S | V | F | N | F | E | E | A | N | V | G | L | L | F | R | H | F | D | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Y | E | K | E | F | Y | R | L | V | E | K | N | L | Y | L | P | A | Y | D | Y | I | L | K | C | S | H | T | F | N | L | L | D | A | R | G | A | I | S | V | S | Q | R | Q | T | Y | V | K | R | I | Q | A | X | A | R | K | A | A | R | V | F | L | E | V | Q | A | N | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
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