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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1iwga8 | Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain | Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain | Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain |
Added to library: Tue Mar 16 12:04:10 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | F | G | W | F | N | R | M | F | E | K | S | T | H | H | Y | T | D | S | V | G | G | I | L | R | S | T | G | R | Y | L | V | L | Y | L | I | I | V | V | G | M | A | Y | L | F | V | R | L | P | S | S | F | L | P | D | S | G | N | Q | A | P | S | L | Y | A | I | S | L | I | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | B | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | L | C | L | A | A | L | Y | E | S | W | S | I | P | F | S | V | M | L | V | V | P | L | G | V | I | G | A | L | L | A | A | T | F | R | G | L | T | N | D | V | Y | F | Q | V | G | L | L | T | T | I | G | L | S | A | K | N | A | I | L | I | V | E | F | A | K | D | L | M | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | E | G | K | G | L | I | E | A | T | L | D | A | V | R | M | R | L | R | P | I | L | M | T | S | L | A | F | I | L | G | V | M | P | L | V | I | S | T | G | A | G | S | G | A | Q | N | A | V | G | T | G | V | M | G | G | M | V | T | A | T | V | L | A | I | F | F | V | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | F | V | V | V | R | R | R | F | S | R | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S |
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