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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1i5pa3 | Toxins' membrane translocation domains | delta-Endotoxin (insectocide), N-terminal domain | delta-Endotoxin (insectocide), N-terminal domain |
Added to library: Tue Mar 16 12:01:16 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | N | N | V | L | N | S | G | R | T | T | I | C | D | A | Y | N | V | V | A | H | D | P | F | S | F | E | H | K | S | L | D | T | I | Q | K | E | W | M | E | W | K | R | T | D | H | S | L | Y | V | A | P | V | V | G | T | V | S | S | F | L | L | K | K | V | G | S | L | I | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | R | I | L | S | E | L | W | G | I | I | F | P | S | G | S | T | N | L | M | Q | D | I | L | R | E | T | E | Q | F | L | N | Q | R | L | N | T | D | T | L | A | R | V | N | A | E | L | I | G | L | Q | A | N | I | R | E | F | N | Q | Q | V | D | N | F | L | N | P | T | Q | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | V | P | L | S | I | T | S | S | V | N | T | M | Q | Q | L | F | L | N | R | L | P | Q | F | Q | I | Q | G | Y | Q | L | L | L | L | P | L | F | A | Q | A | A | N | M | H | L | S | F | I | R | D | V | I | L | N | A | D | E | W | G | I | S | A | A | T | L | R | T | Y | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | ||||||
Sequence | Y | L | R | N | Y | T | R | D | Y | S | N | Y | C | I | N | T | Y | Q | T | A | F | R | G | L | N | T | R | L | H | D | M | L | E | F | R | T | Y | M | F | L | N | V | F | E | Y | V | S | I | W | S | L | F | K | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
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