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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1hc1a2 | Di-copper centre-containing domain | Di-copper centre-containing domain | Hemocyanin middle domain |
Added to library: Tue Mar 16 12:42:17 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | L | Y | Q | I | T | P | H | M | F | T | N | S | E | V | I | D | K | A | Y | S | A | K | M | T | Q | K | P | G | T | F | N | V | S | F | K | N | R | E | Q | R | V | A | Y | F | G | E | D | I | G | M | N | I | H | H | V | T | W | H | M | D | F | P | F | W | W | E | D | S | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | S | S | T | T | S | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | Y | H | L | D | R | K | G | E | L | F | F | W | V | H | H | Q | L | T | A | R | F | D | F | E | R | L | S | N | W | L | D | P | V | D | E | L | H | W | D | R | I | I | R | E | G | F | A | P | L | T | S | Y | K | Y | G | G | E | F | P | V | R | P | D | N | I | H | F | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | B | B | S | S | S | B | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | D | G | V | A | H | V | H | D | L | E | I | T | E | S | R | I | H | E | A | I | D | H | G | Y | I | T | D | S | D | G | H | T | I | D | I | R | Q | P | K | G | I | E | L | L | G | D | I | I | E | S | S | K | Y | S | S | N | V | Q | Y | Y | G | S | L | H | N | T | A | H | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | B | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | M | L | G | R | Q | G | D | P | H | G | K | F | N | L | P | P | G | V | M | E | H | F | E | T | A | T | R | D | P | S | F | F | R | L | H | K | Y | M | D | N | I | F | K | K | H | T | D | S | F | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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