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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1gxja_ | Smc hinge domain | Smc hinge domain | Smc hinge domain |
Added to library: Tue Mar 16 13:42:44 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | F | S | R | A | V | R | A | V | F | E | E | K | E | R | F | P | G | L | V | D | V | V | S | N | L | I | E | V | D | E | K | Y | S | L | A | V | S | V | L | L | G | G | T | A | Q | N | I | V | V | R | N | V | D | T | A | K | A | I | V | E | F | L | K | Q | N | E | A | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | T | B | G | G | G | G | G | G | G | G | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | T | I | L | P | L | D | L | I | D | G | S | F | N | R | I | S | G | L | E | N | E | R | G | F | V | G | Y | A | V | D | L | V | K | F | P | S | D | L | E | V | L | G | G | F | L | F | G | N | S | V | V | V | E | T | L | D | D | A | I | R | M | K | K | K | Y | R | L | N | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | B | G | G | G | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | I | A | T | L | D | G | E | L | I | S | G | R | G | A | I | T | G | G | R | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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