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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1gjia2 | Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f | p53-like transcription factors | Rel/Dorsal transcription factors, DNA-binding domain |
Added to library: Tue Mar 16 12:26:22 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | Y | I | E | I | F | E | Q | P | R | Q | R | G | M | R | F | R | Y | K | C | E | G | R | S | A | G | S | I | P | G | E | H | S | T | D | N | N | K | T | F | P | S | I | Q | I | L | N | Y | F | G | K | V | K | I | R | T | T | L | V | T | K | N | E | P | Y | K | P | H | P | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | B | G | G | G | S | B | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | L | V | G | K | D | C | R | D | G | Y | Y | E | A | E | F | G | P | E | R | R | V | L | S | F | Q | N | L | G | I | Q | C | V | K | K | K | D | L | K | E | S | I | S | L | R | I | S | K | K | I | N | P | F | N | V | P | E | E | Q | L | H | N | I | D | E | Y | D | L | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | ||||||||||
Sequence | V | R | L | C | F | Q | A | F | L | P | D | E | H | G | N | Y | T | L | A | L | P | P | L | I | S | N | P | I | Y | D | N | R | A | P | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | T | T | S |
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