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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1g8ta_ | His-Me finger endonucleases | His-Me finger endonucleases | DNA/RNA non-specific endonuclease |
Added to library: Tue Mar 16 13:06:37 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | I | D | N | C | A | V | G | C | P | T | G | G | S | S | N | V | S | I | V | R | H | A | Y | T | L | N | N | N | S | T | T | K | F | A | N | W | V | A | Y | H | I | T | K | D | T | P | A | S | G | K | T | R | N | W | K | T | D | P | A | L | N | P | A | D | T | L | A | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | S | B | T | T | S | G | G | G | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | Y | T | G | A | N | A | A | L | K | V | D | R | G | H | Q | A | P | L | A | S | L | A | G | V | S | D | W | E | S | L | N | Y | L | S | N | I | T | P | Q | K | S | D | L | N | Q | G | A | W | A | R | L | E | D | Q | E | R | K | L | I | D | R | A | D | I | S | S | V | Y | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | T | S | S | T | T | S | T | T | G | G | G | G | G | B | G | G | G | T | T | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | T | G | P | L | Y | E | R | D | M | G | K | L | P | G | T | Q | K | A | H | T | I | P | S | A | Y | W | K | V | I | F | I | N | N | S | P | A | V | N | H | Y | A | A | F | L | F | D | Q | N | T | P | K | G | A | D | F | C | Q | F | R | V | T | V | D | E | I | E | K | R | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | G | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | ||||||||||||||||||
Sequence | G | L | I | I | W | A | G | L | P | D | D | V | Q | A | S | L | K | S | K | P | G | V | L | P | E | L | M | G | C | K | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | T | T | S | T | S | S | G | G | G | G | G | T |
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