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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | Fold | Superfamily | Family |
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d1ewqa1 | DNA repair protein MutS, domain III | DNA repair protein MutS, domain III | DNA repair protein MutS, domain III |
Added to library: Tue Mar 16 14:39:58 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | G | Q | D | T | L | F | S | V | L | D | E | T | R | T | A | P | G | R | R | L | L | Q | S | W | L | R | H | P | L | L | D | R | G | P | L | E | A | R | L | D | R | V | E | G | F | V | R | E | G | A | L | R | E | G | V | R | R | L | L | Y | R | L | A | D | L | E | R | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | R | L | E | L | G | R | A | S | P | K | D | L | G | A | L | R | R | S | L | Q | I | L | P | E | L | R | A | L | L | G | E | E | V | G | L | P | D | L | S | P | L | K | E | E | L | E | A | A | L | V | E | D | P | P | L | K | V | S | E | G | G | L | I | R | E | G | Y | D | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | B | S | S | S | T | T | S | S | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | L | D | A | L | R | A | A | H | R | E | G | V | A | Y | F | L | E | L | E | E | R | E | R | E | R | T | G | I | P | T | L | K | V | G | Y | N | A | V | F | G | Y | Y | L | E | V | T | R | P | Y | Y | E | R | V | P | K | E | Y | R | P | V | Q | T | L | K | D | R | Q | R | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . |
Sequence | T | L | P | E | X | K | E | K | E | R | E | V | Y | R | L | E | A | L | I | R | R | R | E | E | E | V | F | L | E | V | R | E | R | A | K | R | Q | A | E | A | L | R | E | A | A | R | I | L | A | E | L | D | V | Y | A | A | L | A | E | V | A | V | R | Y | G | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
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