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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8hjaA_ | 2.38 | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: c-di-gmp receptor; |
Added to library: Sat Apr 1 12:17:53 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | I | Q | E | I | F | T | K | A | L | Q | D | G | Y | L | T | P | A | E | A | E | V | G | R | L | C | E | S | G | V | D | L | D | Q | G | E | Y | E | A | L | D | R | L | A | A | L | L | A | G | D | V | V | A | P | H | K | K | F | I | N | V | E | E | V | L | T | E | V | V | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | S | S | S | S | T | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | V | S | K | Y | Q | K | T | T | E | K | Q | P | D | I | A | D | I | A | A | Y | A | L | N | R | L | P | P | L | Y | A | T | S | E | E | G | A | E | Y | Q | R | Q | R | A | S | E | E | L | E | F | L | I | Q | Q | Q | V | K | D | G | L | G | R | Y | F | D | R | P | Q | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | R | K | P | L | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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