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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8h7gD_ | 3.70 | PDB header: transcription | Chain: D: PDB Molecule: transcription factor spt20 homolog; |
Added to library: Sat Dec 17 08:52:13 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | Q | A | L | E | L | A | L | D | R | A | E | Y | V | I | E | S | A | R | Q | R | P | P | S | V | F | Q | K | L | Y | D | L | Y | I | E | E | C | E | K | E | P | E | V | K | K | L | R | R | N | V | N | L | L | E | K | L | V | M | Q | E | T | L | S | C | L | V | V | N | L | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | G | N | E | G | Y | S | L | M | L | S | E | T | I | R | L | P | Y | E | E | G | E | L | L | E | Y | L | D | A | E | E | L | P | P | I | L | V | D | L | L | E | K | S | Q | V | N | I | F | H | C | G | C | V | I | A | E | I | R | D | Y | R | Q | G | Y | Q | S | R | H | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | S | B | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | R | P | T | M | Q | T | L | I | C | D | V | H | S | I | T | S | D | N | H | K | W | T | Q | E | D | K | L | L | L | E | S | Q | L | I | L | A | T | A | E | P | L | C | L | D | P | S | I | A | V | T | C | T | A | N | R | L | L | Y | N | K | Q | K | M | N | T | R | P | M | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | C | F | K | R | Y | S | R | S | S | L | N | R | Q | Q | D | L | S | H | C | P | P | P | P | Q | L | R | L | L | D | F | L | Q | K | R | K | E | R | D | V | K | D | D | Y | V | F | Y | Q | K | T | K | L | T | I | L | Q | S | L | G | D | P | L | Y | Y | G | K | I | Q | P | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||
Sequence | N | W | F | I | I | G | S | K | T | D | A | E | R | V | V | N | Q | Y | Q | E | L | V | Q | N | E | A | K | C | P | V | K | M | S | H | S | S | S | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S |
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