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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8gsf1_ | 3.60 | PDB header: virus/immune system | Chain: 1: PDB Molecule: vp1; |
Added to library: Sat Dec 17 08:56:52 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | H | S | R | T | E | S | S | I | E | N | F | L | C | R | A | A | C | V | Y | I | A | T | Y | A | S | A | G | G | T | P | T | E | R | Y | A | S | W | R | I | N | T | R | Q | M | V | Q | L | R | R | K | F | E | L | F | T | Y | L | R | F | D | M | E | I | T | F | V | I | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | Q | D | P | G | T | Q | L | A | Q | D | M | P | V | L | T | H | Q | I | M | Y | I | P | P | G | G | P | V | P | N | S | A | T | D | F | A | W | Q | S | S | T | N | P | S | I | F | W | T | E | G | C | A | P | A | R | M | S | V | P | F | I | S | I | G | N | A | Y | S | N | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G | G | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | D | G | W | S | H | F | T | Q | E | G | V | Y | G | F | N | S | L | N | N | M | G | H | I | Y | V | R | H | V | N | E | Q | S | L | G | V | S | T | S | T | L | R | V | Y | F | K | P | K | H | V | R | A | W | V | P | R | P | P | R | L | S | P | Y | V | K | S | S | N | V | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | T | T | S | S | B | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | F | K | P | T | A | V | T | T | E | R | K | D | I | N | D | V | G | T | L | R | P | V | G | Y | T | N | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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