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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8gqeA_ | 2.00 | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: wd repeat-containing protein rup2; |
Added to library: Sat Sep 17 10:03:40 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | R | Y | E | W | D | L | S | L | S | T | V | V | S | S | S | S | S | S | A | S | D | V | I | G | A | I | E | F | D | P | T | D | N | I | V | A | T | A | G | I | S | R | K | I | R | F | Y | G | L | P | S | L | L | R | N | N | A | V | S | G | T | G | V | S | F | V | D | Q | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | A | C | E | Y | Y | I | C | T | P | A | K | L | S | S | L | R | W | R | P | G | S | G | G | R | V | I | G | S | G | D | Y | D | G | V | V | M | E | Y | D | L | E | K | R | T | P | V | F | E | R | D | E | H | G | G | R | R | V | W | S | V | D | Y | T | R | H | G | G | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | V | G | A | S | G | S | D | D | G | T | M | Q | V | W | D | P | R | C | P | P | E | E | S | V | G | V | V | R | P | A | G | I | C | R | S | A | V | C | C | V | E | F | D | P | S | G | G | P | A | V | A | V | G | C | A | D | R | K | G | Y | V | Y | D | I | R | K | L | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | A | L | T | L | Q | G | H | T | K | T | V | S | Y | V | R | F | L | D | G | G | T | V | V | T | A | G | T | D | G | C | L | K | L | W | S | V | E | D | G | R | V | I | R | T | Y | E | G | H | V | N | N | R | N | F | V | G | L | S | V | W | R | N | G | A | L | F | G | C | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | S | E | N | N | R | V | F | V | Y | D | R | R | W | G | K | P | V | W | V | D | G | F | E | P | V | G | M | N | S | G | S | D | K | R | F | V | S | S | V | C | W | R | Q | S | G | V | D | Q | C | T | L | V | A | G | G | S | D | G | V | L | Q | V | Y | V | G | K | R | L | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S |
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