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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8f7cE_ | 3.92 | PDB header: membrane protein | Chain: E: PDB Molecule: pannexin-2, soluble cytochrome b562 fusion; |
Added to library: Sat Apr 8 13:32:01 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | L | A | A | L | L | L | Q | L | K | L | E | L | P | F | D | R | V | V | T | I | G | T | V | L | V | P | I | L | L | V | T | L | V | F | T | K | N | F | A | E | E | P | I | Y | C | Y | T | P | H | N | F | T | R | D | Q | A | L | Y | A | R | G | Y | C | W | T | E | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | A | L | P | G | V | D | A | S | L | W | P | S | L | F | E | H | K | F | L | P | Y | A | L | L | A | F | A | A | I | M | Y | V | P | A | L | G | W | E | F | L | A | S | T | R | L | T | S | E | L | N | F | L | L | Q | E | I | D | N | C | Y | H | N | L | F | E | K | Y | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | B | T | S | S | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | R | G | R | S | N | F | L | A | K | L | Y | L | A | R | H | V | L | I | L | L | L | S | A | V | P | I | S | Y | L | C | T | Y | Y | A | T | Q | K | Q | N | E | F | T | C | A | L | G | A | S | P | D | P | A | V | R | V | S | C | K | L | P | S | V | Q | L | Q | R | I | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | V | D | I | V | L | L | C | V | M | N | L | I | I | L | V | N | L | I | H | L | F | I | F | R | K | S | N | F | I | F | D | K | L | H | K | V | G | I | K | T | R | R | Q | W | R | R | S | Q | F | C | D | I | N | I | L | A | M | F | C | N | E | N | R | D | H | I | K | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | R | L | D | F | I | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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