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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8f2eA_ | 2.43 | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: papain-like protease nsp3; |
Added to library: Sat Mar 11 09:55:03 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | T | D | Q | S | S | Y | I | V | D | S | V | T | V | K | N | G | S | I | H | L | Y | F | D | K | A | G | Q | K | T | Y | E | R | H | S | L | S | H | F | V | N | L | D | N | L | R | A | N | N | T | K | G | S | L | P | I | N | V | I | V | F | D | G | K | S | K | C | E | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | G | G | G | G | S | S | G | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | A | K | S | A | S | V | Y | Y | S | Q | L | M | C | Q | P | I | L | L | L | D | Q | A | L | V | S | D | V | G | D | S | A | E | V | A | V | K | M | F | D | A | Y | V | N | T | F | S | S | T | F | N | V | P | M | E | K | L | K | T | L | V | A | T | A | E | A | E | L | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | V | S | L | D | N | V | L | S | T | F | I | S | A | A | R | Q | G | F | V | D | S | D | V | E | T | K | D | V | V | E | C | L | K | L | S | H | Q | S | D | I | E | V | T | G | D | S | C | N | N | Y | M | L | T | Y | N | K | V | E | N | M | T | P | R | D | L | G | A | C | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | S | S | B | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | C | S | A | R | H | I | N | A | Q | V | A | K | S | H | N | I | A | L | I | W | N | V | K | D | F | M | S | L | S | E | Q | L | R | K | Q | I | R | S | A | A | K | K | N | N | L | P | F | K | L | T | C | A | T | T | R | Q | V | V | N | V | V | T | T | K | I | A | L | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | B | S | S |   | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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