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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8egrJ_ | 3.58 | PDB header: virus | Chain: J: PDB Molecule: gp16, tail stem protein; |
Added to library: Sat Dec 17 09:39:16 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | K | H | T | T | T | L | Y | E | I | I | E | S | E | L | Q | R | L | G | L | N | E | F | V | N | N | D | R | I | H | F | N | D | S | K | H | A | F | M | Q | K | M | L | Y | F | D | D | D | V | K | Q | I | V | D | H | M | F | F | K | G | F | M | F | N | D | E | R | I | D | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | F | K | E | S | F | T | L | R | F | L | Y | R | E | I | G | R | Q | T | V | E | S | F | A | S | Q | V | L | Y | I | T | M | T | H | E | D | Y | I | Y | R | V | Y | G | S | D | M | Y | K | Y | I | E | Q | V | T | D | T | Q | S | Q | D | L | G | K | A | I | E | N | A | I | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | B | B | S | S | S | S | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | G | Q | T | K | D | R | Q | Q | D | K | G | H | E | E | Y | K | D | Y | E | D | T | I | T | K | S | F | D | D | N | R | T | A | E | S | T | D | T | N | T | I | S | R | D | K | N | T | S | E | T | V | S | E | K | T | G | T | K | D | N | T | F | D | S | L | R | N | G | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | D | T | K | R | N | T | Q | S | Q | N | E | M | N | R | T | G | L | T | K | Q | Y | L | I | D | N | L | Q | K | L | Y | S | M | R | D | T | I | F | K | T | Y | D | K | E | C | F | L | H | I | W | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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