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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8dmbP_ | 3.10 | PDB header: rna binding protein/rna/dna | Chain: P: PDB Molecule: ubiquitin-like protein smt3,isrb protein,monomeric |
Added to library: Sat Oct 22 12:12:08 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | R | V | P | V | V | G | V | D | G | R | P | L | M | P | T | T | P | R | K | A | R | L | L | I | R | D | G | L | A | V | P | R | R | N | K | L | G | L | F | Y | I | Q | M | L | R | P | V | G | T | R | T | Q | P | V | A | L | A | V | D | P | G | A | K | Y | D | G | V | A | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | B | B | T | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | S | H | R | R | V | E | L | R | A | M | V | F | L | P | D | D | V | P | R | K | M | E | T | R | R | N | L | R | R | A | R | R | Y | R | K | T | P | R | R | P | A | R | F | D | N | R | R | R | K | G | Y | W | L | A | P | T | Q | R | F | K | V | E | A | R | L | K | V | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | L | C | R | I | Y | P | V | Q | L | I | V | T | E | D | V | R | F | N | H | A | R | D | R | N | G | K | Y | F | S | T | V | E | I | G | K | T | L | T | Y | R | E | Y | R | K | L | A | E | L | R | L | V | E | V | S | E | T | D | A | W | R | E | R | F | G | T | H | A | N | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | A | A | M | L | M | G | V | T | G | C | A | H | N | P | A | A | P | F | F | V | W | R | R | L | R | Y | A | R | R | S | L | F | R | Q | N | P | Q | K | D | G | V | R | P | R | F | G | G | T | A | N | G | G | F | F | R | K | G | D | W | V | E | A | E | K | A | G | K | V | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | B | S | S | G | G | G | B | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | |
Sequence | R | G | W | V | C | G | L | P | T | E | T | T | K | L | V | G | V | A | D | A | D | G | K | R | I | G | Q | F | S | P | K | K | V | R | L | L | A | R | S | T | G | F | S | W | K | E | V | A | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | S |
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