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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8dkrB_ | 2.05 | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: large terminase protein; |
Added to library: Sat Sep 10 09:46:37 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | I | P | K | T | G | G | D | K | S | V | I | N | L | K | F | I | L | A | A | I | D | A | H | K | K | L | G | W | E | P | A | G | S | K | R | I | G | F | D | V | A | D | D | G | E | D | A | N | A | T | T | L | M | H | G | N | V | I | M | E | V | D | E | W | D | G | L | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | B | T | T | S | S | T | T | T | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | L | L | K | S | S | S | R | V | Y | N | L | A | K | I | K | G | A | S | V | T | Y | D | S | I | G | V | G | A | H | V | G | S | K | F | A | E | L | N | D | A | S | P | D | F | K | L | I | Y | D | P | F | N | A | G | G | A | V | D | K | P | D | D | V | Y | M | K | L | P | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | S | G | G | G | G | G | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | T | I | K | N | K | D | H | F | S | N | I | K | A | Q | K | W | E | E | V | A | T | R | F | R | K | T | Y | E | A | V | E | H | G | K | V | Y | P | F | D | E | L | I | S | I | N | S | E | T | I | H | P | D | K | L | N | Q | L | C | I | E | L | S | S | P | R | K | D | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | G | G | G | S | G | G | G | S | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | M | N | G | R | F | K | V | E | S | K | K | D | M | R | E | K | R | K | I | K | S | P | N | I | A | D | S | V | I | M | S | A | I | L | P | I | R | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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