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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8dg5K_ | 3.26 | PDB header: rna binding protein/rna | Chain: K: PDB Molecule: loquacious, isoform b; |
Added to library: Sat Nov 19 14:01:47 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | M | K | T | P | V | S | I | L | Q | E | L | L | S | R | R | G | I | T | P | G | Y | E | L | V | Q | I | E | G | A | I | H | E | P | T | F | R | F | R | V | S | F | K | D | K | D | T | F | T | A | M | G | A | G | R | S | K | K | E | A | K | H | A | A | A | R | A | L | I | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | I | N | P | I | G | W | L | Q | E | M | C | M | Q | R | R | W | P | P | P | S | Y | E | T | E | T | E | V | G | L | P | H | E | R | L | F | T | I | A | C | S | I | L | N | Y | R | E | M | G | K | G | K | S | K | K | I | A | K | R | L | A | A | H | R | M | W | M | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | E | T | P | T | Q | H | S | N | K | V | S | Q | F | H | K | T | L | K | N | A | T | G | K | K | L | L | K | L | Q | K | T | C | L | K | N | N | K | I | D | Y | I | K | L | L | G | E | I | A | T | E | N | Q | F | E | V | T | Y | V | D | I | E | E | K | T | F | S | G | Q | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | Q | C | L | V | Q | L | S | T | L | P | V | G | V | C | H | G | S | G | P | T | A | A | D | A | Q | R | H | A | A | Q | N | A | L | E | Y | L | K | I | M | T | K | K | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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