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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8ddyD_ | 2.89 | PDB header: photosynthesis | Chain: D: PDB Molecule: allophycocyanin subunit beta; |
Added to library: Sat Apr 8 14:36:27 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | K | D | T | I | T | S | L | I | N | P | A | D | E | K | G | S | Y | L | D | A | A | A | L | E | Q | L | N | R | Y | F | Q | S | G | N | M | R | V | K | A | A | K | T | I | S | S | S | A | S | S | I | I | S | K | T | V | A | K | S | L | L | Y | G | D | I | T | L | P | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | Y | P | T | R | R | Y | A | A | C | L | R | D | L | T | Y | F | L | R | Y | A | T | Y | A | M | L | A | A | D | P | S | I | L | D | E | R | V | L | Q | G | L | K | E | T | Y | I | T | L | G | V | P | I | D | R | V | I | Q | A | L | N | A | M | K | E | V | L | T | E | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | T | E | A | S | Q | E | M | A | V | Y | L | D | H | I | I | A | G | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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