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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8cspa_ | 2.66 | PDB header: ribosome | Chain: A: PDB Molecule: 12s mitochondrial rrna; |
Added to library: Sat Dec 17 09:53:52 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | R | V | L | R | V | V | L | L | G | A | P | N | A | G | K | S | T | L | S | N | Q | L | L | G | R | K | V | L | G | V | I | T | E | K | E | T | Q | V | I | L | L | D | T | P | G | I | E | D | P | W | K | S | M | E | S | A | D | L | V | V | V | L | V | D | V | S | D | K | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | R | N | Q | L | S | P | Q | L | L | R | C | L | T | K | Y | S | Q | I | P | S | V | L | V | M | N | K | V | D | C | L | K | Q | K | S | V | L | L | E | L | T | A | A | L | T | E | G | V | V | N | G | K | K | L | K | M | R | Q | A | F | H | P | Q | R | I | G | W | P | H | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | S | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | E | I | F | M | L | S | A | L | S | Q | E | D | V | K | T | L | K | Q | Y | L | L | T | Q | A | Q | P | G | T | P | E | E | I | C | A | N | I | I | R | E | K | L | L | E | H | L | P | Q | E | V | P | Y | N | V | Q | Q | K | T | A | V | W | E | E | G | P | G | G | E | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | B | T | T | S | T | T | G | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . |
Sequence | I | Q | Q | K | L | L | V | P | K | E | S | Y | V | K | L | L | I | G | P | K | G | H | V | I | S | Q | I | A | Q | E | A | G | H | D | L | M | D | I | F | L | C | D | V | D | I | R | L | S | V | K | L | L | K | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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