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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8c18A_ | UNK | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: astaxanthin binding fasciclin family protein; |
Added to library: Sat Apr 8 13:28:16 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | P | H | M | A | T | P | K | A | N | A | T | T | A | K | P | A | S | T | T | S | T | P | V | Y | A | T | L | S | N | A | V | T | A | G | A | A | A | P | Q | L | T | T | L | F | A | A | V | R | A | A | N | V | T | G | A | L | T | A | N | T | T | W | T | I | L | A | P | T | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | G | G | G | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | A | F | A | K | R | L | A | K | L | N | L | T | A | D | A | V | L | K | N | K | D | L | L | V | K | I | L | S | Y | H | V | I | P | S | G | A | V | Y | S | K | A | L | K | D | N | A | T | V | A | T | A | L | K | D | A | S | V | T | V | R | L | Y | Q | G | K | V | M | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | G | P | V | N | K | A | Q | V | T | V | A | D | I | K | A | G | G | S | V | I | H | V | I | N | D | V | L | L | P | P | G | V | V | S | D | A | V | A | K | Q | W | K | A | E | W | E | A | M | K | A | E | K | K | V | A | P | K | A | T | T | G | R | R | F | L | L | F | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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