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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8bmwJ_ | 3.50 | PDB header: rna binding protein | Chain: J: PDB Molecule: crispr-associated cas7 paralog (type iii-d); |
Added to library: Sat Mar 4 09:56:54 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | I | R | R | S | N | Y | T | P | R | N | E | K | G | L | E | G | V | I | E | L | Q | L | N | V | V | S | D | Y | L | H | V | G | S | G | K | Y | D | V | E | V | M | R | S | V | S | D | V | K | R | L | V | E | D | Y | L | S | G | G | N | K | R | I | P | N | N | V | D | Q | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | S | M | V | A | F | L | M | V | R | N | K | D | N | V | V | I | P | G | S | T | I | K | G | M | V | R | S | R | L | E | L | S | V | P | G | S | C | Y | I | V | T | G | H | S | T | S | S | S | A | V | Y | K | R | I | F | N | P | D | P | N | R | G | S | D | R | F | D | V | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | S | B | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | F | P | Q | V | C | P | V | C | D | L | L | G | N | M | G | L | A | S | R | V | S | L | S | D | F | V | M | T | S | G | K | V | D | Y | V | N | V | K | G | R | D | Y | E | V | V | T | K | G | S | I | F | A | G | K | V | L | Y | K | S | L | K | P | V | E | I | G | M | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | B | T | T | B | S | B | S | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 |
Sequence | Y | G | F | G | F | V | K | D | C | N | G | S | K | V | M | L | L | G | R | F | K | F | S | D | K | R | F | G | R | V | K | F | S | L | K | T | P | I | A | D | C | N | K | L | V | S | D | F | V | K | Q | F | N | P | R | Y | I | N | E | E | ||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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