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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8aurA_ | 3.47 | PDB header: protein fibril | Chain: A: PDB Molecule: major biofilm matrix component; |
Added to library: Sat Dec 3 11:13:44 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | F | N | D | I | K | S | K | D | A | T | F | A | S | G | T | L | D | L | S | A | K | E | N | S | A | S | V | N | L | S | N | L | K | P | G | D | K | L | T | K | D | F | Q | F | E | N | N | G | S | L | A | I | K | E | V | L | M | A | L | N | Y | G | D | F | K | A | N | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | S | S | S | S | T | T | B | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | N | T | S | P | E | D | F | L | S | Q | F | E | V | T | L | L | T | V | G | K | E | G | G | N | G | Y | P | K | N | I | I | L | D | D | A | N | L | K | D | L | Y | L | M | S | A | K | N | D | A | A | A | A | E | K | I | K | K | Q | I | D | P | K | F | L | N | A | S | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | B | B | S | S | T | S | T | B | G | G | G | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | N | V | A | T | I | D | G | K | T | A | P | E | Y | D | G | V | P | K | T | P | T | D | F | D | Q | V | Q | M | E | I | Q | F | K | D | D | K | T | K | D | E | K | G | L | M | V | Q | N | K | Y | Q | G | N | S | I | K | L | Q | F | S | F | E | A | T | Q | W | N | G | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | I | K | K | D | H | T | D | K | D | G | Y | V | K | E | N | E | K | A | H | S | E | D | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | S | S | B | S | G | G | G | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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