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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c8aouA_ | UNK | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: host translation inhibitor nsp1; |
Added to library: Sat Dec 31 10:47:22 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | M | E | S | L | V | P | G | F | N | E | K | T | H | V | Q | L | S | L | P | V | L | Q | V | R | D | V | L | V | R | G | F | G | D | S | V | E | E | V | L | S | E | A | R | Q | H | L | K | D | G | T | C | G | L | V | E | V | E | K | G | V | L | P | Q | L | E | Q | P | Y | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | S | S | T | T | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | I | K | R | S | D | A | R | T | A | P | H | G | H | V | M | V | E | L | V | A | E | L | E | G | I | Q | Y | G | R | S | G | E | T | L | G | V | L | V | P | H | V | G | E | I | P | V | A | Y | R | K | V | L | L | R | K | N | G | N | K | G | A | G | G | H | S | Y | G | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | ||||
Sequence | L | K | S | F | D | L | G | D | E | L | G | T | D | P | Y | E | D | F | Q | E | N | W | N | T | K | H | S | S | G | V | T | R | E | L | M | R | E | L | N | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | T | T | B | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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