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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7zl1A_ | 2.50 | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: pentraxin-related protein ptx3; |
Added to library: Sat Aug 6 08:36:57 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | G | W | A | A | R | S | W | L | P | A | G | C | E | T | A | I | L | F | P | M | R | S | K | K | I | F | G | S | V | H | P | V | R | P | M | R | L | E | S | F | S | A | C | I | W | V | K | A | T | D | V | L | N | K | T | I | L | F | S | Y | G | T | K | R | N | P | Y | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | L | Y | L | S | Y | Q | S | I | V | F | V | V | G | G | E | E | N | K | L | V | A | E | A | M | V | S | L | G | R | W | T | H | L | C | G | T | W | N | S | E | E | G | L | T | S | L | W | V | N | G | E | L | A | A | T | T | V | E | M | A | T | G | H | I | V | P | E | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | T | T | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | L | Q | I | G | Q | E | K | N | G | C | C | V | G | G | G | F | D | E | T | L | A | F | S | G | R | L | T | G | F | N | I | W | D | S | V | L | S | N | E | E | I | R | E | T | G | G | A | E | S | C | H | I | R | G | N | I | V | G | W | G | V | T | E | I | Q | P | H | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | T | S | T | T | G | G | G | S | S | B | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | Q | Y | V | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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