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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7xurA_ | 3.49 | PDB header: transcription/dna | Chain: A: PDB Molecule: snrna-activating protein complex subunit 4; |
Added to library: Sat Dec 10 09:15:49 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | F | M | K | P | Y | F | K | D | K | V | T | G | V | G | P | P | A | N | E | D | T | R | E | K | A | A | Q | G | I | K | A | F | E | E | L | L | V | T | K | W | K | N | W | E | K | A | L | L | R | K | S | V | V | S | D | R | K | E | I | Q | D | I | N | Q | L | P | E | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | L | W | E | K | I | S | N | I | N | F | A | E | E | I | R | K | F | W | Q | N | S | E | H | P | S | I | N | K | Q | E | W | S | R | E | E | E | E | R | L | Q | A | I | A | A | A | H | G | H | L | E | W | Q | K | I | A | E | E | L | G | T | S | R | S | A | F | Q | C | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | F | Q | Q | H | N | K | A | L | K | R | K | E | W | T | E | E | E | D | R | M | L | T | Q | L | V | Q | E | M | R | V | G | S | H | I | P | Y | R | R | I | V | Y | Y | M | E | G | R | D | S | M | Q | L | I | Y | R | W | T | K | S | L | D | P | G | L | K | K | G | Y | W | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | T | T | B | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | E | E | D | A | K | L | L | Q | A | V | A | K | Y | G | E | Q | D | W | F | K | I | R | E | E | V | P | G | R | S | D | A | Q | C | R | D | R | Y | L | R | R | L | H | F | S | L | K | K | G | R | W | N | L | K | E | E | E | Q | L | I | E | L | I | E | K | Y | G | V | G | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | W | A | K | I | A | S | E | L | P | H | R | S | G | S | Q | C | L | S | K | W | K | I | M | M | G | K | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
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