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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7wwbA_ | 3.86 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: choline transporter-like protein 1; |
Added to library: Sat Jun 25 09:07:15 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | L | E | D | R | S | C | T | D | I | P | W | L | L | L | F | I | L | F | C | I | G | M | G | F | I | C | G | F | S | I | A | T | V | L | S | M | I | L | M | V | I | I | R | Y | I | S | R | V | L | V | W | I | L | T | I | L | F | L | I | M | L | V | M | R | K | R | V | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | I | A | L | F | H | V | A | G | K | V | F | I | H | L | P | L | L | V | F | Q | P | F | W | T | F | F | A | L | V | L | F | W | V | Y | W | I | M | T | L | L | F | L | M | W | W | Y | H | V | V | G | L | I | W | I | S | E | F | I | L | A | C | Q | Q | M | T | V | A | G | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | V | T | Y | Y | F | T | R | D | K | R | N | L | P | F | T | P | I | L | A | S | V | N | R | L | I | R | Y | H | L | G | T | V | A | K | G | S | F | I | I | T | L | V | K | I | P | R | M | I | L | M | Y | I | H | S | Q | L | C | V | L | K | S | C | I | C | C | L | W | C | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | K | C | L | N | Y | L | N | Q | N | A | Y | T | A | T | A | I | N | S | T | N | F | C | T | S | A | K | D | A | F | V | I | L | V | E | N | A | L | R | V | A | T | I | N | T | V | G | D | F | M | L | F | L | G | K | V | L | I | V | C | S | T | G | L | A | G | I | M | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | |||||||||||
Sequence | P | L | I | I | V | C | L | F | A | F | L | V | A | H | C | F | L | S | I | Y | E | M | V | V | D | V | L | F | L | C | F | A | I | D | T | K | Y | N | D | G | S | P | G | R | E | F | Y | M | D | K | V | L | M | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | T | B | S | S |
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