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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7w1mH_ | 6.50 | PDB header: dna binding protein/dna | Chain: H: PDB Molecule: transcriptional repressor ctcf; |
Added to library: Sat Jun 3 17:13:28 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | S | V | Y | D | F | E | E | E | T | F | Q | C | E | L | C | S | Y | T | C | P | R | R | S | N | L | D | R | H | M | K | S | H | T | D | E | R | P | H | K | C | H | L | C | G | R | A | F | R | T | V | T | L | L | R | N | H | L | N | T | H | T | G | T | R | P | H | K | C | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | C | D | M | A | F | V | T | S | G | E | L | V | R | H | R | R | Y | K | H | T | H | E | K | P | F | K | C | S | M | C | D | Y | A | S | V | E | V | S | K | L | K | R | H | I | R | S | H | T | G | E | R | P | F | Q | C | S | L | C | S | Y | A | S | R | D | T | Y | K | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | S | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | H | M | R | T | H | S | G | E | K | P | Y | E | C | Y | I | C | H | A | R | F | T | Q | S | G | T | M | K | M | H | I | L | Q | K | H | T | E | N | V | A | K | F | H | C | P | H | C | D | T | V | I | A | R | K | S | D | L | G | V | H | L | R | K | Q | H | S | Y | I | E | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | K | K | C | R | Y | C | D | A | V | F | H | E | R | Y | A | L | I | Q | H | Q | K | S | H | K | N | E | K | R | F | K | C | D | Q | C | D | Y | A | C | R | Q | E | R | H | M | I | M | H | K | R | T | H | T | G | E | K | P | Y | A | C | S | H | C | D | K | T | F | R | Q | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | ||||||
Sequence | Q | L | L | D | M | H | F | K | R | Y | H | D | P | N | F | V | P | A | A | F | V | C | S | K | C | G | K | T | F | T | R | R | N | T | M | A | R | H | A | D | N | C | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | T |
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