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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7upsB_ | 2.43 | PDB header: cell invasion | Chain: B: PDB Molecule: doty (lpg0294); |
Added to library: Sat Aug 13 08:33:08 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | N | A | T | R | D | A | L | L | K | A | M | Q | V | G | E | T | S | I | E | A | A | E | Y | M | A | T | R | F | E | Q | I | L | T | K | A | K | L | L | P | E | C | N | D | M | L | E | K | I | K | E | Y | A | Q | F | V | K | F | K | L | L | S | S | A | Q | V | W | S | G | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | R | P | T | S | D | Y | Q | N | T | Q | E | N | K | A | E | F | L | A | S | H | L | E | G | L | P | S | G | L | K | L | E | V | A | I | G | D | D | A | K | I | L | R | G | F | S | S | N | G | K | M | V | E | G | D | Q | L | K | T | M | D | G | L | L | E | G | W | L | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | S | L | A | I | S | G | G | A | V | V | K | I | D | N | T | G | N | Q | T | K | V | D | P | Q | E | I | R | Q | L | I | N | D | S | E | K | G | V | A | K | Y | F | A | D | K | G | V | G | M | E | V | A | Q | R | T | Y | Q | E | P | K | A | L | E | T | K | R | E | E | I | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | Q | E | I | E | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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