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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c7ubaA_ | 1.60 | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: horma domain-containing protein; |
Added to library: Sat Apr 1 12:17:02 2023 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | D | I | E | C | E | C | D | L | L | C | P | I | T | S | T | R | I | K | Q | C | K | N | C | R | K | F | V | H | S | L | C | Y | G | N | K | P | G | P | K | V | D | K | C | I | S | C | V | Y | G | P | M | F | D | P | S | S | S | E | F | K | D | L | M | M | L | R | K | C | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | F | L | S | R | N | K | G | F | P | P | S | I | K | E | F | T | N | S | I | M | E | E | G | Q | V | T | L | E | N | I | E | R | I | N | F | C | I | S | T | L | S | S | D | G | I | L | N | F | S | Q | C | G | N | K | V | S | I | D | E | E | G | I | F | V | P | K | I | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | B | S | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||
Sequence | L | L | K | G | R | E | Y | M | C | C | F | I | Y | N | S | D | N | S | H | A | C | Y | L | D | V | S | P | E | S | K | R | Q | I | E | N | W | I | D | Q | V | K | S | I | R | N | D | F | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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